会计机构负责人是指在一个单位内具体负责会计工作的中层领导人员。
总会计师属于公司副总一级领导。因此，总会计师职位高。
1.单位负责人,是单位法定代表人或者法律\行政法规规定代表单位行使职权的主要责任人,其对单位的会计工作和会计资料的真实性\完整性负责.;
2.会计工作负责人是分管财务工作的公司总经理或副总.;
会计机构负责人是财务部门的财务经理,
3.会计主管人员为不设置会计机构,只在其他机构中设置专职会计人员的单位行使会计机构负责人职权的人员.
总会计师和会计工作负责人是不一样的，总会计师是单位行政领导成员,协助单位主要行政领导人工作,直接对单位主要行政领导人负责.
有四方面的不同。
一、职位的不同。
会计机构负责人：指在一个单位内具体负责会计工作的中层领导人员，组织、领导会计机构或会计人员依法进行会计核算，实行会计监督的负责人。
总会计师：在单位主要领导人领导下，主管经济核算和财务会计工作的负责人。
二、职责不同。
会计机构负责人：是公司财务总负责人，对各项财务会计工作要定期研究、布置、检查、总结。
总会计师：是组织领导本单位的财务管理，成本管理，预算管理。
三、设置范围不同。
会计机构负责人：只要设置会计机构，就应当配备会计机构负责。
总会计师：国有的和国有资产占控股地位或者主导地位的一些大、中型国有企业才有实行总会计师制度。
四、任职条件不同。
会计机构负责人：除取得会计从业人员资格证书外，还应当具备会计师以上专业技术职务资格或者从事会计工作三年以上，在政治素质、工作经历、政策业务水平、组织能力、身体情况也有严格要求。
总会计师：取得会计师专业技术资格或持有总会计师（CFO）资格证书，主管一个单位或者单位内部一个重要方面的财务会计工作的时间不少于3年。
参考资料来源：百度百科--总会计师
参考资料来源：百度百科--会计机构负责人
总会计师不是会计机构负责人。
总会计师，是组织领导本单位的财务管理，成本管理，预算管理。会计核算和会计监督等方面的工作，参与本单位重要经济问题分析和决策的单位行政领导人员，总会计师协助单位主要行政领导人员工作，直接对单位主要行政领导人负责。
所以总会计师不是一种专业技术职务，也不是会计机构的负责人或会计主管人员，而是一种行政职务。总会计师的职责：进行成本费用预测、计划、控制、预算、分析和考核，督促本单位有关部门降低消耗、节约费用，提高经济效益。
会计人员的地位：
新修订的《会计法》没有对总会计师的地位作出明确规定，但在作为《会计法》重要的配套法规《总会计师条例》中明确予以规定：总会计师是单位领导成员，协助单位主要领导人工作，直接对单位主要领导人负责。
总会计师作为单位财务会计的主要负责人，全面负责本单位的财务会计管理和经济核算，参与本单位的重大经营决策活动，是单位主要领导人的得力参谋和助手。
因此，为了保障总会计师有职有权，充分发挥总会计师的作用，根据长期的实践经验，凡设置总会计师的单位不能再设置与总会计师职责重叠的副职。总会计师依法行使职权，应受到法律的保护，任何人包括任何单位主要领导人在内，都不得阻碍总会计师依法行使职权。
