两个办法，第一是让对方公司给账上补钱，第二是和对方协调退票，用其余方式结算。如果以上两种办法对方都不采纳，那可以直接起诉对方，因为对方这种行为是给你开“空头支票”，这种是违法行为。
拓展资料：
空头支票是指支票持有人请求付款时，出票人在付款人处实有的可供合法支配的存款不足以支付票据金额的支票。票据法规定支票出票人所签发的支票金额不得超过其在付款人处实有的存款金额，即不得签发空头支票，这就要求出票人自出票日起至支付完毕止，保证其在付款人处的存款账户中有足以支付支票金额的资金。
对签发空头支票骗取财物的，要依法追究刑事责任。如果签发空头支票骗取财物的行为情节轻微，不构成犯罪，票据法规定要依照国家有关规定给予行政处罚。
对于空头支票的处罚规定如下：
按支票金额的5%且不低于1000元的标准罚款（由人民银行执行）；同时持票人可以要求支票金额2%的赔偿。
一、如果对方开的是空头支票，银行已经收了支票并做帐务处理。银行首先要通知对方将帐面款项存足，以支付这笔款项。如对方未在规定时间内将款项存足，那么会受到对方开户银行对他的罚款，对方开户银行有义务将此款支付给你公司。如你公司与开户银行往来对帐单中无此款入帐，你应该以存支票时银行盖印的进帐单去核对具体情况。根据情况具体对待。也就是说，先同银行核对此款是否已到帐。否则，对方开据空头支票是违返票据法的！
二、如果没到帐，起诉的话需要该空头支票原件、银行拒绝付款的证书原件、你们之间基础法律关系的证据（如买卖合同）、被告单位的工商基本资料。如果该支票上有背书的，在上面背书过的单位或者个人也列为被告，到法院起诉，诉讼费由原告先交付，由败诉方承担。
单位签发的支票票面金额，超过其在银行存款的余额或透支限额而不能生效的支票。即为空头支票。
签发空头支票是套用银行信用，破坏结算纪律的行为，在我国，银行按规定要对签发空头支票的单位按票面金额的比例进行处罚。
此外,票据法规定支票出票人所签发的支票金额不得超过其在付款人处实有的存款金额，即不得签发空头支票，这就要求出票人自出票日起至支付完毕止，保证其在付款人处的存款账户中有足以支付支票金额的资金。对签发空头支票骗取财物的，要依法追究刑事责任。如果签发空头支票骗取财物的行为情节轻微，不构成犯罪，票据法规定要依照国家有关规定给予行政处罚。
法律分析：支票自出票日起十日内有效，过期就作废了。钱还在原来的账户上，还会计息的，只是这张支票作废了而已。
法律依据：《中华人民共和国票据管理实施办法》第三十一条签发空头支票或者签发与其预留的签章不符的支票，不以骗取财物为目的的，由中国人民银行处以票面金额5%但不低于1000元的罚款。中国人民银行及其分支机构依据上述规定对空头支票的出票人予以处罚。空头支票的罚款，由出票人在规定期限内到指定的罚款代收机构主动缴纳;逾期不缴纳的，中国人民银行及其分支机构可采取下列措施：
1、到期不缴纳罚款的，每日按罚款数额的3%加处罚款;
2、要求银行停止其签发支票;
3、申请人民法院强制执行。
客户给你开的支票，但是账号里没有钱，等于给你开了一个空头支票，你拿去银行也没有办法。不过，支票有几天时间，你可以每天去银行看一下，说不定他今天没钱，明天就会有钱，不妨试试。
你只要取回支票，七日后在去存，要是还没钱。你不用管他的开户行也得罚他。对方不愿意给你送张新支票,是因为账户里没钱给你新支票也是一回事，一样跳票。
跳票∶若银行通知所存入的票据跳票,要向银行询问跳票原因,因为跳票的原因不只是存款不足,包括印章不对、模糊、票据涂改等因素都可能产生跳票。若是存款不足跳票,应向原银行取回票据,并妥加保存。因为,发票人若是七日内补足金额,便可注销跳票记录,所以七日后可再存入支票.第一个重点是票据借给他人使用,如果使用人开票,但不把钱存入帐户内,必然会造成退票（俗称跳票）,但如果能够在帐户内补足足够金额（俗称补票）,就不会影响到日后继续开支票。必须注意的是,即使可以继续开票,退票和补票注记都会在银行、票据交换所,以及联合征信中心留下纪录。这种纪录并不是好纪录,多少会影响到日后申办贷款。第二个重点是有关拒绝往来户的认定,以票据使用来说,如果有三次退票未补的情形,就会变成拒绝往来户,以后三年也不能再使用票据。这当然是不好的信用纪录,会影响到贷款申办。
对空头支票、签章不符的按照票面金额的5%，但不低与1000元的罚款。
